В docuploads после загрузки файлов, открыть снова редактирование записи и там можно указать описание для каждого файла.
Еще мы сделали опцию
Сохранять физические названия загруженных файлов (use_native_file_name_on_uploadify)
Она позволяет сохранить названия загруженных файлов.